Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms