Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FYCO1Q9BQS8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms