Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPIN3Q9BQK8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms