Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SPOCK3Q9BQ16 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SPOCK3Q9BQ16 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SPOCK3Q9BQ16 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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SPOCK3Q9BQ16 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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