Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms