Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF6

COQ10A, Coenzyme Q-binding protein COQ10 homolog A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10AQ96MF6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COQ10AQ96MF6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COQ10AQ96MF6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms