Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACSBG1Q96GR2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSBG1Q96GR2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSBG1Q96GR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ACSBG1Q96GR2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms