Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms