Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SMIM12Q96EX1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SMIM12Q96EX1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SMIM12Q96EX1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SMIM12Q96EX1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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