Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms