Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCCAG3Q96C92 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms