Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms