Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG4Q92954 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms