Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOPBP1Q92547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOPBP1Q92547 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms