Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APH1BQ8WW43 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms