Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms