Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms