Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms