Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC24Q8N4L8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC24Q8N4L8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms