Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCL2Q8N4E4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms