Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LNX2Q8N448 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LNX2Q8N448 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms