Protein–RNA interactions for Protein: Q8N268

C20orf197, Uncharacterized protein C20orf197, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf197Q8N268 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C20orf197Q8N268 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms