Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTROBQ8N137 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTROBQ8N137 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTROBQ8N137 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTROBQ8N137 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms