Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TREML1Q86YW5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TREML1Q86YW5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms