Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms