Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSH2Q76I76 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms