Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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USP34Q70CQ2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP34Q70CQ2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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