Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KIAA0408Q6ZU52 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms