Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms