Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms