Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms