Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GARNL3Q5VVW2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms