Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC58Q4VC31 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms