Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWISTNBQ3B726 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms