Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms