Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CA9Q16790 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CA9Q16790 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CA9Q16790 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CA9Q16790 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms