Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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SSX1Q16384 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSX1Q16384 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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