Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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