Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms