Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIP10Q15642 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms