Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms