Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL9A3Q14050 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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