Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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TUBA3CQ13748 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms