Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRSQ13332 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms