Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHAF1BQ13112 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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