Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
LCP2Q13094 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LCP2Q13094 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms