Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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