Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB40BQ12829 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB40BQ12829 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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