Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GALNT1Q10472 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GALNT1Q10472 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GALNT1Q10472 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GALNT1Q10472 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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