Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD47Q08722 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD47Q08722 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD47Q08722 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD47Q08722 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms